유전자원 구조 분석
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Linkage Disequilibrium
유전자간의 거리가 가까워 독립적인 recombination의 형태를 보이지 않는 경우, 유전자가 기대치 이상으로 연관되어 나타나는데, 이를LD (Linkage Disequilibrium, 연결 불균형)라 합니다.
LD는 유전자와 함께 움직이는 SNP 마커를 이용하여 Recombination을 계산한 후, 연관된 정도를 파악하고 유전자간 상대적인 거리를 예측하여 분석합니다. LD 분석을 바탕으로 Linkage dragging을 해결할 수 있고, 또한 특정 형질 유전자의 위치가 대략적으로 추정되면, 그 영역이 특정 형질 유전자의 발현에 실제 관여하는지를 실험으로 검증할 수 있습니다.
LD는 유전자와 함께 움직이는 SNP 마커를 이용하여 Recombination을 계산한 후, 연관된 정도를 파악하고 유전자간 상대적인 거리를 예측하여 분석합니다. LD 분석을 바탕으로 Linkage dragging을 해결할 수 있고, 또한 특정 형질 유전자의 위치가 대략적으로 추정되면, 그 영역이 특정 형질 유전자의 발현에 실제 관여하는지를 실험으로 검증할 수 있습니다.
Work Flow
Result Examples
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| ■ LD block이 생성된 LD plot | ■ LD block의 chromosom상 위치와 gene의 분포 |
