Alternative Splicing analysis
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Alternative Splicing analysis
Alternative Splicing(AS)은 한 개의 유전자좌에서 여러 type의 mRNA가 만들어 지는 유전자 발현 조절 현상입니다.
NGS를 통해 생산된 대용량의 sequence 정보는 AS 연구의 새로운 기회를 제공하고 있으며동물에서 뿐만 아니라 식물에서도 매우 높은 빈도의 AS 형태가 보고되고 있습니다.
씨더스에서는 RNA to genome 방식의 여러 mapping 툴 등을 도입하여 다양한 AS형태를 선별하고, 해당 tools 등의 결과물 등을 통해 직접 browse 등을 통해 제공해 드리고 있어 연구자들이 기존의 표 형태로 간단한 결과만 받아보고 끝나는 것이 아니라, 직접 눈으로 대상을 확인하여 보다 정확성 높고 의미 있는 결과를 얻을 수 있도록 도와 드립니다.
Work Flow
Result Examples
■ 샘플에서 유전자의 AS Type별 Alternative Splicing Count 결과
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| ■ 분석상 Alternative Splicing Type | ■ Reference 기존 mRNA 대비 raw read mapping 결과 |
관련 분석 사례 (2건)
목록
| # | 소속기관 | 관련분석명 |
|---|---|---|
| 1 | 대학교 | 유채 RNAseq의 Alternative splicing 분석 |
| 2 | 국공립(연) | 애기장대 RNAseq의 Alternative splicing 분석 |
