(주)씨더스

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씨더스는 데이터 분석 결과를 차별화된 방법으로 해석하고 정리하여, 기존의 수치 위주의 결과가 아닌 이해하기 쉬운, 즉 시각적인 웹 데이터베이스를 구현하여 정보를 서로 공유하거나 소통할 수 있도록 해드리고 있습니다.

1. 분자마커 실용화를 위한 DB > 육종 지원

먼저는 작물의 유전체 정보를 효율적으로 활용할 수 있도록 해석하여 제공하는 웹 인터페이스를 제공하고 있습니다.

특별히 유전체 정보와 형질관련 유용유전자를 제공함으로써 MAS (maker-assisted selection)와 MAB (marker-assisted backcrossing)

확립에 필요한 다양한 정보를 제공합니다.

유전체 정보와 육종 간 상호 소통 및 활용이 원활하도록 지원하는 가교역할을 수행할 것으로 기대하고 있습니다.

(실 DB구축 예3) TGsol (Translational Genomics for Solanaceae; http://tgsol.seeders.co.kr)

TGsol은 가지과 작물의 유전체 정보를 육종분야에서 활용할 수 있도록 해석하여 제공하는 특화된 웹 인터페이스입니다.

토마토, 감자 등 가지과 작물의 유전체 정보를 이용하여 GAB (Genome Assisted Breeding)를 지원하는 웹 인터페이스를 구축하는 것을 목표로 하고 있습니다.

토마토, 고추, 감자의 유전체 정보를 기반으로 한

MAB(Marker-Assisted Backcrossing), MAS (Marker-Assisted Selection), Genome browser, Comparative analysis, Tool(BLAST 등)

을 다룰 수 있는 메뉴가 제공되고, 목표형질인 병 저항성, 과실발달, 유용 대사산물의 공개된 문헌정보를 수집∙가공한 데이터 기반의 Marker 검색도구가 제공됩니다.

※ 농촌진흥청 차세대 바이오그린21사업(과제번호:PJ009063)의 지원에 의해 진행중임.

(실 DB구축 예3) TGsol - MAB 화면

2. Integrated Omics DB > (Genome + Transcriptome + Metabolome)

최근 NGS를 포함한 Genome + Transcriptome + Metabolome 과 같은 다양한 omics 데이터가 축적되고 있습니다.

이들 정보를 통합하고 활용도를 증진하기 위한 DB를 구축하여 드립니다.

(실 DB구축 예4) 버섯류 유전체, 전사체 정보 활용 통합 DB