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GBS | 원산지 구분 및 품종 구분 마커 개발, GBS가 답입니다!

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작성자 오재은 작성일17-05-12 14:40 조회652회 댓글0건

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원산지 구분 품종 구분 마커 개발,
 
GBS가 답입니다!
 
 
 표준유전체 유무에 따른 자생자원의 원산지 구분, 품종 구분 마커 개발 전략  
 
 1) 표준 유전체가 있는 경우 (Reference genome)
 
GBS sequencing > Barcode demultiplexing > Adapter, Sequence Trimming > Genome alignment > Marker Detection & Application
40여종 이상의 표준유전체가 공개된 주요작물 및 생물에서
GBS 기반 품종 구분, 원산지 구분 분자마커 개발
 
|고추 유전체 특징| 약 2.7Gb의 거대게놈, |과수(포도) 유전체 특징| Heterozygous가 높은 게놈
 2) 표준 유전체가 없는 경우 (No Reference genome)
 
  | Case1 | 60~80X 게놈 시퀀싱을 이용한 Draft genome assembly를 통해!
 
Genome sequencing > Genome de novo Assembly > Draft Genome > GBS sequencing & analysis
|들깨| 약 680Mb 게놈 염기서열 해독, F2 집단 GBS 분석, 유전지도 작성, |인삼| 약 3Gb 게놈 염기서열 해독, 유전자원 GBS 분석, 품종구분 마커 개발
 
  | Case2 | 거대게놈의 RNA-seq을 통해!
 
RNA sequencing > RNA de novo Assembly > Reference Gene set > GBS sequencing & analysis
|프리지아| 유전자원 집단 GBS 분석, 품종구분 마커 개발, |백합| 약 90Gb 거대 게놈 예상, 유전자원 GBS 분석, 원산지 구분 마커
 
 자생자원 집단 유전체 GBS 분석을 통해 선발한 마커 
 
 
원산지 구분 SNP 마커 기반 Phylogenetic tree
 
 
PCA (Principal component analysis)
 
 
유전자원 품종 구분 SNP 마커 바코드
 
 
표준유전체가 없어도 충분한 수의 마커 확보가 가능합니다! 
 
 
                                                                                                                                                        
 
GBS 및 분자마커 분석 컨설팅 문의
 
조환 영업부장
T   010-5420-0051
E   chowhan@seeders.co.kr
 
남문 연구소장
T   010-2607-5344
E   moonlit51@seeders.co.kr
 
 
 

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