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품종 구분 마커 개발

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품종 구분 마커 개발

품종 구분 마커는 품종들 간의 유전체 염기서열 차이(SNP or In/Del)를 분석해 비교적 빠르게 품종을 판별할 수 있는 분자마커 기술입니다. 
품종 구분 마커를 활용하여 종자의 혼입과 같이 육안으로는 구분이 불가능한 경우에 마커를 사용하여 판별합니다. 
품종 구분 마커 검정을 위해선 비교 가능한 품종 개체들의 Resequencing이나 GBS 데이터를 이용하여 변이 마커를 확보하고, 품종 간 구분이 가능한 마커를 선발하고 조합하여 품종을 판별할 수 있는 마커 세트를 개발할 수 있습니다. 

Work Flow

Result Examples

■ 품종 구분 마커 관련 SNP 선발 및 정보 엑셀 파일 예시


관련 분석 사례 (76건)

목록

# 소속기관 관련분석명
1정부출연(연)멸구 GBS 기반 종구분 마커 탐색
2대학교검은썩음병, 과실썩음병 WGS 기반 race specific In/Del 마커 개발
3정부출연(연)수수 WGS기반 품종구분 마커세트 개발
4정부출연(연)알팔파 WGS 기반 품종 구분 마커 탐색
5국공립(연)복어 GBS data를 이용한 품종구별 SNP 마커 개발
6대학교토마토 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
7정부출연(연)들깨 RNA data를 이용한 샘플 간의 SSR 마커 개발
8국공립(연)상추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 & GWAS 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발
9대학교고구마 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발
10국공립(연)다시마 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 변이 탐색
11국공립(연)푸사리움 GBS data를 이용한 병원성/비병원성 샘플 간의 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 개발
12국공립(연)참깨 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발
13국공립(연)홍화 유전자원 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 SNP 마커개발
14대학교배추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 개발
15국공립(연)사과 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
16대학교유채 GBS data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 개발
17기업부설(연)사과 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
18대학교단감 RNA data를 이용한 샘플 간의 SSR 마커 개발
19기업부설(연)감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, SSR 마커 개발
20기업부설(연)국화 RNA data를 이용한 샘플 간의 SSR 마커 개발
21대학교딸기 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발
22대학교석곡 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발
23국공립(연)만가닥버섯 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 개발
24기업부설(연)박테리아 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, PAV 변이 탐색
25기업부설(연)사과 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
26기업부설(연)Colletotrichum GBS data를 이용한 품종구별 SNP 마커 개발
27국공립(연)백합 유전자원 GBS data를 이용한 품종구별 SNP 마커 개발
28국공립(연)프리지아 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발
29국공립(연)고구마 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발
30대학교보이젠베리 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발
31대학교스테비아 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발
32국공립(연)곰팡이 SangerSeq. data를 이용한 de novo assembly 수행, Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 개발
33대학교딸기 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
34대학교고추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
35국공립(연)피 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 돌피/논피 품종구별 SNP 마커 개발
36대학교땅콩 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 개발
37기업부설(연)감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 개발
38대학교고추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 개발
39국공립(연)고추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
40정부출연(연)콩 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
41국공립(연)푸사리움 Whole genome sequencing data를 이용한 de novo assembly 수행 및 샘플 간의 In/Del, SSR 마커 개발
42대학교배추 Resequencing data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발
43대학교클로렐라 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
44대학교고추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
45대학교벼 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
46국공립(연)포도 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 개발
47대학교한라봉 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
48기업부설(연)감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 개발
49대학교멜론 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
50국공립(연)사과 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 개발
51대학교양송이 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 개발
52기업부설(연)클라미도모나스 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
53대학교고추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 개발
54국공립(연)벼 Resequencing data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 & 원산지 구별 SNP, In/Del 마커 세트 개발
55국공립(연)보리 Resequencing data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 & 원산지 구별 SNP, In/Del 마커 세트 개발
56기업부설(연)수박 GBS data를 이용한 두 품종 간의 SNP 마커 개발
57국공립(연)블루베리 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 개발
58기업부설(연)감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 개발
59국공립(연)감자 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색
60대학교배 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 개발
61국공립(연)참다래 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
62기업부설(연)감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
63기업부설(연)감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
64국공립(연)동충하초 Resequencing data를 이용한 SNP 변이 탐색
65기업부설(연)탄저병원균 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색
66국공립(연)배 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 변이 탐색
67기업부설(연)고추 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
68국공립(연)수박 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 개발
69국공립(연)복숭아 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 개발
70기업부설(연)수박 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색
71기업부설(연)양배추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색
72기업부설(연)양파 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 개발
73대학교콩 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색
74대학교양배추 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, SSR 마커 개발
75국공립(연)인삼 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 개발
76국공립(연)감자 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP 변이 탐색

관련 논문 사례 (2건)

Genotyping-by-sequencing based single nucleotide polymorphisms enabled Kompetitive Allele Specific PCR marker development in mutant Rubus genotypes
Single nucleotide polymorphism (SNP) discovery through genotyping-by￾sequencing (GBS) and genetic characterization of Dendrobium mutants and cultivars
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관련 씨더스 웹진 (4건)

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Genotyping-by-sequencing based single nucleotide polymorphisms enabled Kompetitive Allele Specific PCR marker development in mutant Rubus genotypes
Single nucleotide polymorphism (SNP) discovery through genotyping-by￾sequencing (GBS) and genetic characterization of Dendrobium mutants and cultivars
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