품종 구분 마커 개발
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품종 구분 마커 개발
품종 구분 마커는 품종들 간의 유전체 염기서열 차이(SNP or In/Del)를 분석해 비교적 빠르게 품종을 판별할 수 있는 분자마커 기술입니다.
품종 구분 마커를 활용하여 종자의 혼입과 같이 육안으로는 구분이 불가능한 경우에 마커를 사용하여 판별합니다.
품종 구분 마커 검정을 위해선 비교 가능한 품종 개체들의 Resequencing이나 GBS 데이터를 이용하여 변이 마커를 확보하고, 품종 간 구분이 가능한 마커를 선발하고 조합하여 품종을 판별할 수 있는 마커 세트를 개발할 수 있습니다.
품종 구분 마커를 활용하여 종자의 혼입과 같이 육안으로는 구분이 불가능한 경우에 마커를 사용하여 판별합니다.
품종 구분 마커 검정을 위해선 비교 가능한 품종 개체들의 Resequencing이나 GBS 데이터를 이용하여 변이 마커를 확보하고, 품종 간 구분이 가능한 마커를 선발하고 조합하여 품종을 판별할 수 있는 마커 세트를 개발할 수 있습니다.
Work Flow
Result Examples
■ 품종 구분 마커 관련 SNP 선발 및 정보 엑셀 파일 예시
관련 분석 사례 (79건)
목록
| # | 소속기관 | 관련분석명 |
|---|---|---|
| 1 | 대학교 | 수박 부모 및 RIL 집단의 WGS 기반 SNP 마커 및 QTL 탐색 |
| 2 | 기업 | 딸기 WGS 데이터를 이용한 genome-wide SNP 마커 탐색 |
| 3 | 대학교 | 콩 WGS 데이터를 이용한 genome-wide SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 4 | 정부출연(연) | 멸구 GBS 기반 종구분 마커 탐색 |
| 5 | 대학교 | 검은썩음병, 과실썩음병 WGS 기반 race specific In/Del 마커 탐색 |
|---|---|---|
| 6 | 정부출연(연) | 수수 WGS기반 품종구분 마커세트 개발 |
| 7 | 정부출연(연) | 알팔파 WGS 기반 품종 구분 마커 탐색 |
| 8 | 국공립(연) | 복어 GBS data를 이용한 품종구별 SNP 마커 탐색 |
| 9 | 대학교 | 토마토 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 10 | 정부출연(연) | 들깨 RNA data를 이용한 샘플 간의 SSR 마커 탐색 |
| 11 | 국공립(연) | 상추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 & GWAS 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 12 | 대학교 | 고구마 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 13 | 국공립(연) | 다시마 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 변이 탐색 |
| 14 | 국공립(연) | 푸사리움 GBS data를 이용한 병원성/비병원성 샘플 간의 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 탐색 |
| 15 | 국공립(연) | 참깨 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 16 | 국공립(연) | 홍화 유전자원 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 SNP 마커 탐색 |
| 17 | 대학교 | 배추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
| 18 | 국공립(연) | 사과 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 19 | 대학교 | 유채 GBS data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
| 20 | 기업부설(연) | 사과 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 21 | 대학교 | 단감 RNA data를 이용한 샘플 간의 SSR 마커 탐색 |
| 22 | 기업부설(연) | 감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, SSR 마커 탐색 |
| 23 | 기업부설(연) | 국화 RNA data를 이용한 샘플 간의 SSR 마커 탐색 |
| 24 | 대학교 | 딸기 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 25 | 대학교 | 석곡 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 26 | 국공립(연) | 만가닥버섯 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
| 27 | 기업부설(연) | 박테리아 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, PAV 변이 탐색 |
| 28 | 기업부설(연) | 사과 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 29 | 기업부설(연) | Colletotrichum GBS data를 이용한 품종구별 SNP 마커 탐색 |
| 30 | 국공립(연) | 백합 유전자원 GBS data를 이용한 품종구별 SNP 마커 탐색 |
| 31 | 국공립(연) | 프리지아 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 32 | 국공립(연) | 고구마 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 33 | 대학교 | 보이젠베리 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 34 | 대학교 | 스테비아 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 35 | 국공립(연) | 곰팡이 SangerSeq. data를 이용한 de novo assembly 수행, Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 탐색 |
| 36 | 대학교 | 딸기 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 37 | 대학교 | 고추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 38 | 국공립(연) | 피 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 돌피/논피 품종구별 SNP 마커 탐색 |
| 39 | 대학교 | 땅콩 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 40 | 기업부설(연) | 감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
| 41 | 대학교 | 고추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 42 | 국공립(연) | 고추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 43 | 정부출연(연) | 콩 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 44 | 국공립(연) | 푸사리움 Whole genome sequencing data를 이용한 de novo assembly 수행 및 샘플 간의 In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 45 | 대학교 | 배추 Resequencing data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 46 | 대학교 | 클로렐라 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 47 | 대학교 | 고추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 48 | 대학교 | 벼 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 49 | 국공립(연) | 포도 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
| 50 | 대학교 | 한라봉 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 51 | 기업부설(연) | 감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 52 | 대학교 | 멜론 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 53 | 국공립(연) | 사과 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 54 | 대학교 | 양송이 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 55 | 기업부설(연) | 클라미도모나스 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 56 | 대학교 | 고추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
| 57 | 국공립(연) | 벼 Resequencing data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 & 원산지 구별 SNP, In/Del 마커 세트 개발 |
| 58 | 국공립(연) | 보리 Resequencing data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 & 원산지 구별 SNP, In/Del 마커 세트 개발 |
| 59 | 기업부설(연) | 수박 GBS data를 이용한 두 품종 간의 SNP 마커 탐색 |
| 60 | 국공립(연) | 블루베리 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 61 | 기업부설(연) | 감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 62 | 국공립(연) | 감자 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색 |
| 63 | 대학교 | 배 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 64 | 국공립(연) | 참다래 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 65 | 기업부설(연) | 감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 66 | 기업부설(연) | 감귤 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 67 | 국공립(연) | 동충하초 Resequencing data를 이용한 SNP 변이 탐색 |
| 68 | 기업부설(연) | 탄저병원균 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색 |
| 69 | 국공립(연) | 배 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 변이 탐색 |
| 70 | 기업부설(연) | 고추 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 71 | 국공립(연) | 수박 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
| 72 | 국공립(연) | 복숭아 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
| 73 | 기업부설(연) | 수박 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색 |
| 74 | 기업부설(연) | 양배추 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색 |
| 75 | 기업부설(연) | 양파 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 76 | 대학교 | 콩 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색 |
| 77 | 대학교 | 양배추 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, SSR 마커 탐색 |
| 78 | 국공립(연) | 인삼 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
| 79 | 국공립(연) | 감자 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP 변이 탐색 |
