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• SEEDERSWEBZINE_vol12_GBS분석결과_LunaProbeAssay(주)씨더스.pdf (785.7K) 194회 다운로드 DATE : 2017-04-11 13:22:54

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 GBS 분석결과 

 

Luna probe assay를 이용한 Real-time PCR로 확인하세요!

                                                                                                                    

 

 

   GBS(Genotyping-by-Sequencing)는 유전체 수준의 분석 및 SNP 발굴 목적으로 가장 보편적으로 활용되는 분석 방법으로 자리잡고 있습니다. 특별히 자원 집단, 교배 집단 같이 다수의 시료를 분석할 수 있는 강점으로 인하여 적용사례가 빠르게 증가하고 있습니다.

  GBS를 통해 확보된 SNP를 실험적으로 확인하는 방법 중 하나인 Luna probe assay를 소개하고자 합니다.

  Luna probe assay 분석법은  unlabeled probe 방식으로 기존 SNP 검증 방법인 HRM(High Resolution Melting)에 비해 정확도 및 마커 전환율이 탁월하고, Taqman probe, KASP 보다 probe 비용이 저렴하여 SNP 검정에  효율적인 분석입니다. Luna probe assay를 활용한 SNP 검정에 도전해보세요!

 

 

 1  고품질의 GBS 분석을 통한 SNP 마커 확보

 

 

40여종 이상의 주요작물 및 생물에서 GBS 분석 사례를 보유하고 있으며, 다양한 종을 대상으로 지속적으로 확장하고 있습니다.

   • 다양한 품종 구분용 마커 개발

   • MABC용 마커 개발

   • 목적형질 식별 마커 개발

   • 원산지 구별 마커 개발

 

 

 

 2  생물정보분석 (다양한 응용분석)

 

 1) 품종 구분 및 원산지 구분용 마커 개발

 

  2) Phylogenetic tree

  3) QTL mapping

 

  4) PCA (Principal component analysis)

  5) GWAS (Genome-wide association study)

 

 

 3  Luna probe 용 분자마커 개발

 

토마토 MABC 집단의 GBS 분석을 통해 선발한 SNP 마커의 Luna probe assay 진행, 약 99% 의 정확도를 확인! MABC용 최종 마커 선발!

 

 

<토마토 MABC 집단의 Genotyping 결과>

 

 

                                                                                                                                                                                            

 

GBS library 제작 및 분석 컨설팅 문의

 

조환 영업부장

T   010-5420-0051

E   chowhan@seeders.co.kr

 

남문 연구소장

T   010-2607-5344

E   moonlit51@seeders.co.kr

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