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GBS | GBS분석결과, Luna probe assay를 이용한 Real-time PCR로 확인하세요!

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작성자 오재은 작성일17-04-11 11:02 조회497회 댓글0건

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 GBS 분석결과 
 
Luna probe assay를 이용한 Real-time PCR확인하세요!
                                                                                                                    
 
 
   GBS(Genotyping-by-Sequencing)는 유전체 수준의 분석 및 SNP 발굴 목적으로 가장 보편적으로 활용되는 분석 방법으로 자리잡고 있습니다. 특별히 자원 집단, 교배 집단 같이 다수의 시료를 분석할 수 있는 강점으로 인하여 적용사례가 빠르게 증가하고 있습니다.
  GBS를 통해 확보된 SNP를 실험적으로 확인하는 방법 중 하나인 Luna probe assay를 소개하고자 합니다.
  Luna probe assay 분석법은  unlabeled probe 방식으로 기존 SNP 검증 방법인 HRM(High Resolution Melting)에 비해 정확도 및 마커 전환율 탁월하고, Taqman probe, KASP 보다 probe 비용이 저렴하여 SNP 검정에  효율적인 분석입니다. Luna probe assay를 활용한 SNP 검정에 도전해보세요!
 
 
 1  고품질의 GBS 분석을 통한 SNP 마커 확보
 
GBS 분석사례
 
40여종 이상의 주요작물 및 생물에서 GBS 분석 사례를 보유하고 있으며, 다양한 종을 대상으로 지속적으로 확장하고 있습니다.
   • 다양한 품종 구분용 마커 개발
   • MABC용 마커 개발
   • 목적형질 식별 마커 개발
   • 원산지 구별 마커 개발
 
GBS 결과
 
 
 2  생물정보분석 (다양한 응용분석)
 
 1) 품종 구분 및 원산지 구분용 마커 개발
품종 구분 및 원산지 구분용 마커 개발
 
  2) Phylogenetic tree
phylogenetic tree
  3) QTL mapping
QTL
 
  4) PCA (Principal component analysis)
PCA
  5) GWAS (Genome-wide association study)
 
GWAS
 
 3  Luna probe 용 분자마커 개발
 
토마토 MABC 집단의 GBS 분석을 통해 선발한 SNP 마커의 Luna probe assay 진행, 약 99% 의 정확도를 확인! MABC용 최종 마커 선발!
luna
 
 
tomatoMABC
<토마토 MABC 집단의 Genotyping 결과>
 
 
                                                                                                                                                                                            
 
GBS library 제작 및 분석 컨설팅 문의
 
조환 영업부장
T   010-5420-0051
E   chowhan@seeders.co.kr
 
남문 연구소장
T   010-2607-5344
E   moonlit51@seeders.co.kr

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