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[GBS] GBS 기반 유전 분석
GBS 기반 유전 분석 교배집단 또는 다양한 유전자원을 대상으로 한 대량 분자 마커 탐색 및 집단 유전학 분석 기술 GBS (genotyping-by-sequencing)는 차세대 염기서열 분석 (NGS) 방법을 기반으로 교배집단 또는 다양한 유전자원 (96 sample/1 …
작성일
21-02-03 13:31
조회
580
[software] 식물과 육종을 아는 생물정보분석 전문 기업 씨더스
식물과 육종을 아는 생물정보분석 전문 기업 씨더스 SEEDERS의 생물 정보 분석 서비스 씨더스는 고객분들이 연구과제 프로젝트 진행 과정 중 요구되는 초기단계의 연구설계, 생물정보 생산에서 생물정보분석과 분자마커 개발 및 이를 활용하는 영역까지, 다양한 기술 개발 및 다년간의 분석경험을 축적하였습니다. 이를 기반으로 생물유전체 …
작성일
21-02-03 11:07
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516
[software] Densitree 와 Phylogenetic tree 알아보기
유전적 다양성 및 집단 구조 분석 2 Densitree 와 Phylogenetic tree 알아보기 유전적 다양성과 집단의 구조 분석은 여러 방법을 통해 진행할 수 있습니다. 그 중에서도 Phylogenetic tree는 일반적으로 생물 종 간의 계층적 구조를 볼 수 있는 한 방법으로, 종 사이의 유연관계 …
작성일
21-02-03 10:39
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509
[software] DAPC와 PCA 알아보기
유전적 다양성 및 집단 구조 분석 1 DAPC와 PCA 알아보기 PCA(Principal components anlaysis)는 연구자 분들이 그룹간 유전적 구조를 확인하는 유용한 방법론으로 연구에 많이 활용하고 있습니다. 그런데 2010년 이후로 DAPC (Discriminant Analysis of Princ…
작성일
21-02-03 10:15
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479
[software] 다양한 생물정보 분석 경험으로 여러분들과 가치를 함께 합니다.
유전체 정보를 활용한 생물정보분석 전문기업 씨더스는 고객분들이 연구과제 프로젝트 진행 과정 중 요구되는 초기단계의 연구설계 , 생물정보 생산에서 생물정보분석과 분자마커 개발 및 이를 활용하는 영역까지 , 다양한 기술 개발 및 다년간의 분석경험을 축적하였습니다 . 이를 기반으로 생물 유전체 데이터를 활용한 다양한 목적의 생물정보 …
작성일
20-03-16 10:12
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744
[GBS] GBS 분석, 100배 활용하기!!!
GBS(Genotyping By Sequencing) 기반의 유전 분석교배집단 또는 다양한 유전자원을 대상으로 대량 분자마커 탐색 , 집단 유전학 분석 기술GBS (genotyping-by-sequencing) 는 차세대 염기서열 분석 (NGS) 방법을 기반으로 교배집단 또는 다양한 유전자원 (96sample/1library) 에서대량…
작성일
20-03-16 10:05
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990
[transcirptome] Long non-coding RNAs (LncRNAs) 분석
Long non-coding RNAs (LncRNAs) 분석추가 시퀀싱 없이, 기존 RNAseq 데이터를 이용하여 gene expression 분석, LncRNAs 분석을 동시에 진행 가능! Non-coding RNA (ncRNA) 는 DNA 에서 전사되지만, 단백질은 형성되지 않는 기능을 갖는 RNA…
작성일
19-09-16 11:56
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1163
[software] Customizing Web Database 구축
Customizing Web Database 구축 NGS 정보 활용을 위한 고객의 맞춤형 웹 데이터베이스 구축 유전체 데이터를 포함한 다양한 오믹스 정보가 빠르게 축적되면서 이러한 데이터는 우리의 연구환경에서 기본이 되었습니다. 이제는 수많은 빅데…
작성일
19-03-07 16:16
조회
918
[transcirptome] RNA-seq 기반 유전자 발현 프로파일링
RNA-seq 기반 유전자 발현 프로파일링 RNAseq 데이터를 이용해 원하는 대사 경로의 특정 유전자 발현 값의 패턴 분석 RNAseq 분석을 통해 표준유전체가 완료된 생물뿐만 아니라 진행 중인 생물체를 대상으로 관심 있는…
작성일
19-01-30 11:20
조회
1985
[genome] Chloroplast genome assembly 및 annotation 을 통한 유연관계분석
Chloroplast genome assembly 및 annotation 을 통한 유연관계분석 Chloroplast genome은 녹색식물에 존재하는 세포소기관으로 식물의 대사작용의 중심으로써 광합성과 다른 대사과정에 필요한 주요 단백질들을 …
작성일
19-01-08 18:45
조회
1109
[genome] 돌연변이 계통의 Structural variations 분석
돌연변이 계통의 Structural variations 분석 구조변이 (Structural variation)는 일반적으로 동일한 종의 개체들 사이에서 결실(deletion), 삽입(insertion), 중복(duplication), 역위(inversion) 및 전좌(translocation)를 포함한 변이를 말합니…
작성일
18-12-20 16:46
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1412
[software] 육종지원용 웹 Database 구축
육종지원용 웹 Database 구축 유전체 정보 실용화를 지원하는 웹 인터페이스 개발 씨더스는 유전체 정보의 소통 및 산업화를 위한 데이터베이스의 활용을 돕고자 현장(연구팀 혹은 커뮤니티)의 의견을 유기적으로 교환하여 다양한 웹 데이터베이스를 구축하여 공유하는데 노력해 왔습니다. 이러한 과정에서 습득하고 누…
작성일
18-09-07 14:00
조회
1053
[GBS] GBS 기반 SNP 마커 활용 집단 유전 분석 씨더스와 함께하세요!
GBS(Genotyping By Sequencing) GBS - 집단 샘플을 대상으로 대량 분자마커 탐색, 집단 유전학 분석 기술 GBS(genotyping-by sequencing)는 차세대 염기서열 분석(NGS) 방법을 기반으로 집단(96sample/1lib…
작성일
18-08-09 14:40
조회
2426
[transcirptome] RNA-sequencing 씨더스와 함께하세요!
RNA-seq 기반유전자 발현 프로파일링 RNAseq 데이터를 이용해 원하는 대사 경로의 특정 유전자 발현 값의 패턴 분석 RNAseq 분석을 통해 표준유전체가 완료된 생물뿐만 아니라 진행 중인 생물체를 대상으로 관심 있는 현상에 관여하는 유전자가 무엇인지, 유전자 발현 변화와 패턴을 분석…
작성일
18-07-03 11:47
조회
1988
[GBS] 씨더스와 함께하면 GBS 분석이 가능합니다!
벼 집단의 GBS 분석을 통해 게놈 전체에서 균형 있게 시퀀싱 결과(reads)를 확보할 수 있음을 확인했습니다.
작성일
16-02-02 14:34
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