Genome de novo assembly
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Organelle genome assembly (Chloroplast, Mitochondria)
Chloroplast 및 Mitochondria genome은 일반적으로 모계 유전되며, 보존 된 유전자 영역을 가지고 있습니다. 보존된 유전자 영역을 이용하여 식물 종의 계통 연구 및 식물 종을 식별하는데 많이 이용됩니다.
Chloroplast 및 Mitochondria 게놈의 de novo assembly를 수행하여 하나의 Circular contig를 생성하는 것이 목표입니다. Nuclear genome으로부터 Chloroplast 및 Mitochondria 게놈을 분리하는 번거로움 없이 Whole genome sequencing data를 이용하여 de novo assembly 수행을 통해 genome서열을 작성합니다.
Chloroplast 및 Mitochondria 게놈의 de novo assembly를 수행하여 하나의 Circular contig를 생성하는 것이 목표입니다. Nuclear genome으로부터 Chloroplast 및 Mitochondria 게놈을 분리하는 번거로움 없이 Whole genome sequencing data를 이용하여 de novo assembly 수행을 통해 genome서열을 작성합니다.
Work Flow
Result Examples
■ Chloroplast genome assembly 결과 통계치
관련 분석 사례 (1건)
목록
# | 소속기관 | 관련분석명 |
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1 | 대학교 | 아스파라거스목 Whole genome sequencing data를 이용한 chloroplast do novo assembly 및 annotation 분석 |