Genome-wide SNP/Indel/SSR
Resequencing data를 이용한 SNP,Indel analysis | RNA data를 이용한 SNP,Indel analysis | SSR analysis
Resequencing data를 이용한 SNP,Indel analysis
단일 염기 다형성 (Single Nucleotide Polymorphism; SNP)이나 small insertion/deletion polymorphism 은 유전체에서 가장 빈번하게 발생하는 다형성으로, 유전적 다양성 및 표현형 변이에 기여하고 있습니다.
기존에 Reference가 있는 경우, Resequencing을 통해 유전체 수준에서의 SNP와 small In/del 등의 변이를 탐지할 수 있습니다.
기존에 Reference가 있는 경우, Resequencing을 통해 유전체 수준에서의 SNP와 small In/del 등의 변이를 탐지할 수 있습니다.
Work Flow
[ Genome이 있는 경우 ]
Result Examples
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■ Genome structure에 따른 SNP (In/Del) 분류 통계치 | ■ SNP 분석 결과 엑셀파일 |
관련 분석 사례 (13건)
목록
# | 소속기관 | 관련분석명 |
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1 | 대학교 | 토마토 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
2 | 대학교 | 빨간배추 RNA data를 이용한 색깔 형질관련 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
3 | 정부출연(연) | 고구마 RNA data를 이용한 저온저장성관련 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
4 | 국공립(연) | 만가닥버섯 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
5 | 국공립(연) | 참다래 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
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6 | 정부출연(연) | 오이 RNA data를 이용한 저온/병저항성/병 처리 샘플 간의 SNP, In/Del 변이 탐색 |
7 | 기업부설(연) | 고추 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del 마커 탐색 |
8 | 국공립(연) | 복숭아 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
9 | 기업부설(연) | 양파 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
10 | 대학교 | 양배추 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, SSR 마커 탐색 |
11 | 국공립(연) | 인삼 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP, In/Del, SSR 마커 탐색 |
12 | 국공립(연) | 감자 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP 변이 탐색 |
13 | 대학교 | 억새 RNA data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |