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GBS | 씨더스와 함께 GBS 분석을 시작하세요!

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작성자 오재은 작성일17-03-13 15:01 조회677회 댓글0건

본문

  
 
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      We've made High quality GBS library in various species!      
 
 씨더스는 최근 10개월 간 누적 30여 건의 GBS 분석을 수행하며 얻은 자체 노하우로 GBS library 제작부터 생물정보분석까지 탄탄한 분석 파이프라인을 구축하였습니다.
 
 1. 다양한 분석 사례 보유!  
 
 식량(벼, 들깨, 콩, 피 등), 채소(고추, 토마토, 수박, 박, 배추, 양배추, 무 등), 과수(사과, 배, 포도 등) 및 어류(조피볼락, 넙치)까지 다양한 생물의 GBS 분석을 수행하였고 이러한 경험을 통해 분석 노하우를 얻을 수 있었습니다.
 
GBS분석사례
 
 
 2. GBS library 제작 기술 확보!  
 
 ApeKI, MspI 등의 제한효소를 이용하여 고품질의 library를 제작하였고, 자체 기술을 통해 adapter dimer를 최소화 하였습니다. 또한 DNA fragments의 길이를 170-350bp 정도로 하여 library  제작 조건을 최적화 하였습니다. 
 
GBS library 제작 결과
 
 
 
     We've done also Excellent Bioinformatics analysis!     
 
 품종 구분용 마커, 원산지 구별 마커, 목적형질 식별 및 MABC용 마커를 빠르게 확보할 수 있으며, Introgression 영역 탐색, 유전지도(linkage map)작성 등에 활용할 수 있습니다.
 
GBS_bioinformatics_pipeline
 1. 높은 Data 회수율!  
 
 Barcode de-multiplexing & adaptor trimming 기술 최적화로 상용 프로그램 (TASSEL) 대비 높은 Data 회수율을 갖습니다.
 
높은Data회수율
 2. 높은 Data 신뢰도!
 
  유전체 전체에서 균형 있게 충분한 GBS reads depth를 확보할 수 있습니다.
 
높은Data신뢰도
 
 3. 높은 Data 정확도!
 
  GBS 기반 SNP 결과가 Resequencing(WGS) 기반 SNP 결과와 90% 이상 일치합니다.
 
높은Data정확도
 
 
 
 
                                                                                                                                                                                                                     
 
 
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