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[GBS 기술] 씨더스, 유전체 빅데이터로 농업계에 새로운 패러다임을 제시
유전체 빅데이터로 농업계에 새로운 패러다임을 제시 - (주)씨더스 조성환대표 이슈메이커 김도윤 기자 issuedo@issuemaker.kr 2009년 미국에서 상용화 된 NGS는 유전체와 관련된 전 분야에 새로운 판도를 제시했다. 이에 시간·비용 절감은 물론 유전체 정보 생산이 폭발적으로…
작성일
16-03-23 15:26
조회
3586
[GBS 기술] 씨더스와 함께 GBS 분석을 시작하세요!
GBS library construction workflow 1)샘플들 간의 gDNA농도 차이가 최소화 되어야함. 2)증폭된 DNA fragment가 170-350bp 내에 있어야 함. 3)Adapter dimers를 제거해야 함.
작성일
16-03-02 18:15
조회
2669
[GBS 기술] GBS | 씨더스와 함께 GBS 분석을 시작하세요!
GBS는 차세대 염기서열분석 방법을 기반으로 하여 저렴한 비용으로 게놈 분석이 가능한 최신의 NGS분석 기술입니다. 다양한 시료에서 분석이 가능하며, 식물 집단(96 sample /1 library)을 대상으로 빠르고 효과적으로 분자마커를 개발할 수 있습니다.
작성일
16-01-05 11:19
조회
3746
[GBS 기술] 표준유전체해독과 고밀도 유전지도 작성
표준유전체해독과 고밀도 유전지도 작성 (pseudo-molecule 작성 및 assembly 검정) Celela Genomics사에서 shotgun genome sequencing 방식으로 Human genome project에서 큰 반향을 일으킨 후, Genome assembly 기술…
작성일
15-10-05 19:03
조회
4196
[GBS 기술] GBS (Genotyping-by-sequencing) 알아보기
GBS (Genotyping-by-sequencing) 알아보기 ◆ 분자마커와 육종 ‘농업의 반도체’ 혹은 ‘Golden seed’라고 불리는 종자주권을 둘러싸고 세계 각국의 경쟁이 뜨겁다. 경쟁력의 핵심은 시장의 요구에 빠르게 부응할 수 있는 우수한 신품종을…
작성일
15-09-17 13:51
조회
10548
[Web database] 메리크리스마스 !! 씨더스에서 선물을 드립니다 !!
작성일
14-12-26 10:13
조회
2861
[RNAseq] RNA-seq 데이터만으로 다양한 분석 결과의 통합적인 분석이 가능하다.
NGS를 이용한 RNA-seq 분석의 효율성은 동일한 데이터에서 매우 다양한 종류의 결과를 얻을 수 있다는 점입니다. 즉, 하나의 RNA-seq 데이터로 유전자의 발현량을 비교하는 분석을 수행하거나, SNP, In/Del, alternative splicing과 같은 유전자 구조에 대한 분석도 가능하며 이러한 결과를 통합하여 해석하는…
작성일
14-06-24 16:51
조회
10073
[Genome] Genome de novo Assembly
인간뿐만 아니라 동물, 식물, 미생물의 연구에서 표준유전체(reference genome)의 확보 및 완성을 목표로 하는 de novo assembly가 활발하게 시도되고 있습니다.씨더스에서는 genome size가 작은 생물의 de novo assembly를 통해 축적한 기술적 노하우를 바탕으로 large genome size가 예측되…
작성일
14-06-24 11:37
조회
5214
[Web database] 나도 해보자, 바이오 인포메틱스! NGS 분석 소프트웨어 SPADE
SEEDERS의 기술적 노하우를 접목한 다양한 분석 프로그램을 탑재한 소프트웨어를 개발하였습니다!리눅스 서버 뿐만 아니라 Cloud 서버 시스템과의 연동이 가능해저렴한 비용으로 연구자분께서 직접 분석을 할 수 있는 소프트웨어 입니다. 씨더스의 기술적 노하우를 접목한 4가지 분석 파이프라인에 분석과정의 단순화, …
작성일
14-06-23 15:27
조회
6491
[Genome] 정밀육종을 위한 SNP Molecular Marker 개발
표준유전체 정보가 밝혀지고 NGS(Next Generation Sequencing)를 이용한 대용량 시퀀스 생산이 가속화되면서 유전체 기반의 분자육종은 종자시장 및 육종산업에 새로운 동력으로 각광받고 있습니다. 분자육종은 원하는 형질의 유무를, 형질에서 유래한 표현형의 관찰 없이 DNA 염기서열의 차이를 보이는 분자마커(molecular mar…
작성일
14-05-19 11:09
조회
8901
[RNAseq] 공동연구를 통한 양배추 RNA-SEQ을 이용한 유전자 서열 조립 논문 발표 (PLoS ONE저널에 2014년…
씨더스의 전사체 분석팀은 한국생명공학연구원의 권석윤 박사님 실험실과 공동연구를 통해 양배추(Brassica oleracea var. capitata L.)의 transcriptome de novo assembly를 통한 유전자서열조립을 주제로 PLoS ONE 저널에 2014년 3월 28일자로 등재되었습니다. 식물 분야에서 NGS 기술을 …
작성일
14-05-19 10:32
조회
4295
[Web database] 유전체 정보 실용화를 지원하는 웹 데이터베이스 개발
NGS 기술의 개발은 유전체 분석의 가속화를 이끌어현재 다수의 식물 유전체가 해독이 되었으며, 방대한 양의 신규 및 비교 유전체 정보,이른바 빅데이터(Big data)가 생산되어, 이를 처리하기 위한 기술 개발이 요구되고 있습니다. 범세계적으로 표준유전체 해독과 같은 작물 유전체연구가 핵심집단, 육종 주요…
작성일
14-05-19 09:31
조회
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