Stuctural variation 분석
PAV | CNV | DEL, INS, INV, ITX, CTX Stuctural variation
PAV (Present/Absent variation)
유무 변이(presence/absence variation; PAV)는 유전자의 특정 염기서열이 개체마다 존재하거나, 하지 않거나 하는 유전자 존재 유무에 따른 변이를 말합니다. 유전자 구조변이 (Structural variation)의 한 종류로, 삽입(insertion) 또는 삭제(deletion)에 해당됩니다.
PAV는 유전적 다양성에 기여하며 표현형 변이에 중요한 영향을 준다고 보고되었으며, 이러한 PAV를 발굴하기 위해 NGS 데이터를 사용하여 개체 간의 read depth의 차이를 통해 PAV를 탐색합니다.
PAV는 유전적 다양성에 기여하며 표현형 변이에 중요한 영향을 준다고 보고되었으며, 이러한 PAV를 발굴하기 위해 NGS 데이터를 사용하여 개체 간의 read depth의 차이를 통해 PAV를 탐색합니다.
Work Flow
Result Examples
■ 비교조합 개체 간의 PAV gene 선발 결과
관련 분석 사례 (1건)
목록
# | 소속기관 | 관련분석명 |
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1 | 기업부설(연) | 박테리아 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 SNP, PAV 변이 탐색 |