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Resequencing을 통한 Genome wide SNP 분석

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작성자 최고관리자 작성일11-10-24 20:27 조회2,022회 댓글0건

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   주식회사 씨더스에서는 A종, B종, C종의 Resequencing을 통한 Genome wide SNP 분석을 수행하였습니다.
본 연구에서는 A종, B종, C종의 Resequencing Data을 정리하여 본 결과 위의 표와 같은 결과를 얻었습니다.
 

 
A종, B종, C종의 Resequencing Data는 각각 두 개의 file의 형태로 제공받았습니다read수는 86,549,828(*101bp=)개였으며, 이것의 크기는 8,741,532,628bp으로 Genome coverage는 약 37.2X임을 확인 할 수 있습니다.
 
 
이러한 데이터를 이용하여 각 Chromosome에 분류하여 SNP를 선발한 결과 다음과 같은 표를 얻을 수 있습니다.
 
 
 
이렇게 분류된 SNP의 결과를 통해 100kb당 위치한 SNP의 분포도를 확인 할 수도 있습니다.
 
 
위의 그림과 같은 패턴을 3개의 종, A종, B종, C종과의 비교 연구 또한 수행할 수 있습니다.
 

 


 

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