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GBS 분석 관련 문의사항

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작성자 김정은 작성일18-02-21 16:59 조회348회 댓글1건

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안녕하십니까. 저는 molecular 전공 학생입니다. 귀사의 분석에 대해서 질문을 드리고 싶어 이렇게 글을 남깁니다.
조금 너무 광범위한 질문일 수도 있습니다만,
만약에 작물에서 분리집단에서 GBS분석을 하게 되면 이제 회사에서 SNP 정보와 QTL을 찾아주시거나 고객의 요구에 따른 이렇게 분석을 해주시게 되는데요. 그럼 혹시 그 집단에서 나온 SNP 정보를 같은 종이라면 다른 컬티바의 집단에서도 적용이 가능한지요? 아니면, 집단이 생길때마다 GBS분석을 다시하여서 다시 마커를 찾고 validation하는 과정을 거쳐야 하는지요?
물론 종이 같다고 해도 컬티바가 다르니깐 모든 SNP가 다 들어맞지 않겠지만 그래도 종이 같다면 SNP가 대충은 비슷하게 되는지 궁금합니다.
답변 기다리겠습니다. 감사합니다. 

댓글목록

jhlee님의 댓글

jhlee 작성일

문의하신 내용에 답변 드립니다
 말씀하신 것처럼 SNP 마커는 사용하실수 있습니다.
 그러나, 집단이 바뀌면 부모개체간의 차이에 따라 polymorphism 이 있을 수도 있고, 없을 수도 있어서 다시 확인하는 과정이 필요합니다.
 그리고, 집단이 바뀌면 자손내의 재조합에 의한 교차된 영역이 바뀌고, QTL 형질정보도 바뀌기 때문에
 QTL 분석을 위해서는 집단에 맞게 분석을 진행합니다.

 도움이 되셨으면 합니다.~