유전자원 구조 분석
Phylogenetic tree | PCA | Structure | DAPC | Linkage disequilibrium
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Phylogenetic tree
일반적으로 Phylogenetic tree는 생물 종 간의 계층적 구조를 볼 수 있는 한 방법으로, 종 사이의 진화적 관계를 나타내는 도표입니다.
유전자원 집단의 NGS data를 이용하여 SNP 마커를 확보하고, Phylogenetic tree 작성을 통해 유전자원 간의 유연관계를 시각적으로 확인할 수 있습니다.
유전자원 집단의 NGS data를 이용하여 SNP 마커를 확보하고, Phylogenetic tree 작성을 통해 유전자원 간의 유연관계를 시각적으로 확인할 수 있습니다.
Work Flow
Result Examples
■ Phylogenetic tree 결과 (왼쪽: Singh UM, et al. 2014; 오른쪽: Wang A, et al. 2015)
관련 분석 사례 (35건)
목록
| # | 소속기관 | 관련분석명 |
|---|---|---|
| 1 | 기업부설(연) | 붉은불개미 GBS data를 이용한 유연관계 분석 |
| 2 | 국공립(연) | 남생이 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 원산지 구별 SNP 마커 개발 |
| 3 | 기업부설(연) | 화상병 GBS data를 이용한 지역샘플 간의 유연관계 분석 |
| 4 | 국공립(연) | 상추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 & GWAS 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 5 | 대학교 | 고구마 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
|---|---|---|
| 6 | 국공립(연) | 푸사리움 GBS data를 이용한 병원성/비병원성 샘플 간의 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 개발 |
| 7 | 국공립(연) | 참깨 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 8 | 국공립(연) | 토마토 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
| 9 | 국공립(연) | 홍화 유전자원 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 SNP 마커개발 |
| 10 | 국공립(연) | 벼 유전자원 Resequencing data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
| 11 | 국공립(연) | 벼 유전자원 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
| 12 | 국공립(연) | 버섯 개체 간의 Phylogenetic tree 작성 |
| 13 | 대학교 | 수박 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 유연관계 분석 및 색 형질관련 SNP, In/Del, SSR 변이 탐색 |
| 14 | 대학교 | 배 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 유연관계 분석 |
| 15 | 국공립(연) | 배추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 뿌리혹병 관련 GWAS 분석 |
| 16 | 국공립(연) | 애멸구 GBS data를 이용한 지역별 유연관계 분석 |
| 17 | 대학교 | 딸기 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 18 | 대학교 | 석곡 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 19 | 국공립(연) | 벼 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 병저항성 관련 GWAS 분석 |
| 20 | 기업부설(연) | 양배추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
| 21 | 국공립(연) | 토마토 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 병저항성 품종 간의 SNP 마커 개발 |
| 22 | 기업부설(연) | 인삼 GBS data를 이용한 유연관계 분석 |
| 23 | 국공립(연) | 넙치 GBS data를 이용한 암컷 조기/후기 집단 간의 유연관계 & GWAS 분석 및 SNP 마커 개발 |
| 24 | 국공립(연) | 프리지아 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 25 | 국공립(연) | 고구마 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 26 | 대학교 | 배 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 유연관계 분석 |
| 27 | 국공립(연) | 벼 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 병저항성 관련 GWAS 분석 |
| 28 | 대학교 | 보이젠베리 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 29 | 대학교 | 스테비아 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
| 30 | 국공립(연) | 곰팡이 SangerSeq. data를 이용한 de novo assembly 수행, Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 개발 |
| 31 | 국공립(연) | 넙치 GBS data를 이용한 수컷 조기/후기 집단 간의 유연관계 & GWAS 분석 및 SNP 마커 개발 |
| 32 | 국공립(연) | 양배추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
| 33 | 국공립(연) | 피 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 돌피/논피 품종구별 SNP 마커 개발 |
| 34 | 대학교 | 사과 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 유연관계 분석 |
| 35 | 대학교 | 사과 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 유연관계 분석 |
