유전자원 구조 분석
Phylogenetic tree | PCA | Structure | DAPC | Linkage disequilibrium
Structure
Population structure는 인구 유전학에서 가장 많이 연구되었지만 이해되지 않은 영역을 갖고 있는 분야 중 하나입니다.
Structure분석은 SNP 마커를 이용하여 유전적 구조를 분석합니다. 구분되는 Population을 추정하고, 개체를 Population에 할당하고, Hybrid 영역을 연구하고, 이동하는 개체(migrant) 및 혼합된 개체(admixed)를 식별하는 것을 포함합니다. Structure 분석은 유전적 다양성을 이해하는데 활용될 수 있습니다.
Structure분석은 SNP 마커를 이용하여 유전적 구조를 분석합니다. 구분되는 Population을 추정하고, 개체를 Population에 할당하고, Hybrid 영역을 연구하고, 이동하는 개체(migrant) 및 혼합된 개체(admixed)를 식별하는 것을 포함합니다. Structure 분석은 유전적 다양성을 이해하는데 활용될 수 있습니다.
Work Flow
Result Examples
■ Population structure 결과 (Maurya R, et al. 2015)
관련 분석 사례 (27건)
목록
# | 소속기관 | 관련분석명 |
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1 | 기업부설(연) | 붉은불개미 GBS data를 이용한 유연관계 분석 |
2 | 국공립(연) | 남생이 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 원산지 구별 SNP 마커 탐색 |
3 | 기업부설(연) | 화상병 GBS data를 이용한 지역샘플 간의 유연관계 분석 |
4 | 국공립(연) | 상추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 & GWAS 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
5 | 대학교 | 고구마 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
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6 | 국공립(연) | 푸사리움 GBS data를 이용한 병원성/비병원성 샘플 간의 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 탐색 |
7 | 국공립(연) | 참깨 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
8 | 국공립(연) | 홍화 유전자원 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 SNP 마커 탐색 |
9 | 국공립(연) | 토마토 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
10 | 대학교 | 수박 Resequencing data를 이용한 샘플 간의 유연관계 분석 및 색 형질관련 SNP, In/Del, SSR 변이 탐색 |
11 | 국공립(연) | 벼 유전자원 Resequencing data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
12 | 국공립(연) | 벼 유전자원 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
13 | 대학교 | 배 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 유연관계 분석 |
14 | 국공립(연) | 애멸구 GBS data를 이용한 지역별 유연관계 분석 |
15 | 국공립(연) | 배추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 뿌리혹병 관련 GWAS 분석 |
16 | 국공립(연) | 벼 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 병저항성 관련 GWAS 분석 |
17 | 국공립(연) | 토마토 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 병저항성 품종 간의 SNP 마커 탐색 |
18 | 기업부설(연) | 양배추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
19 | 기업부설(연) | 인삼 GBS data를 이용한 유연관계 분석 |
20 | 국공립(연) | 넙치 GBS data를 이용한 암컷 조기/후기 집단 간의 유연관계 & GWAS 분석 및 SNP 마커 탐색 |
21 | 국공립(연) | 프리지아 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
22 | 국공립(연) | 고구마 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
23 | 대학교 | 배 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 유연관계 분석 |
24 | 국공립(연) | 벼 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 병저항성 관련 GWAS 분석 |
25 | 국공립(연) | 양배추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
26 | 국공립(연) | 넙치 GBS data를 이용한 수컷 조기/후기 집단 간의 유연관계 & GWAS 분석 및 SNP 마커 탐색 |
27 | 국공립(연) | 피 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 돌피/논피 품종구별 SNP 마커 탐색 |