유전자원 구조 분석
Phylogenetic tree | PCA | Structure | DAPC | Linkage disequilibrium
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유전자원 구조 분석 목록
Phylogenetic tree
유전자원의 Resequencing 또는 GBS data를 이용하여 SNP 마커를 확보하고, Phylogenetic tree 작성을 통해 유연관계를 분석합니다.
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PCA
유전자원의 Resequencing 또는 GBS data를 이용하여 SNP 마커를 확보하고, PCA 작성을 통해 유전자원의 구조를 분석합니다.
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Structure
유전자원의 Resequencing 또는 GBS data를 이용하여 SNP 마커를 확보하고, STRUCTURE 작성을 통해 유전자원의 구조를 분석합니다.
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DAPC(Discriminant Analysis of Principal Components)
유전자원의 Resequencing 또는 GBS data를 이용하여 SNP 마커를 확보하고, DAPC 작성을 통해 유전자원의 구조를 분석합니다. 특히, 유전적으로 관련된 그룹 간 차이를 볼 때 유용합니다.
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Linkage Disequilibrium
유전자원의 Resequencing 또는 GBS data를 이용하여 SNP 마커를 확보하고, 유전자와 함께 움직이는 SNP 마커를 이용하여 recombination 정도를 계산합니다. 계산된 수치를 통해 유전자간 상대적인 거리를 예측하여 분석합니다.
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