유전지도 작성
유전지도 작성 | QTL analysis
유전지도 작성
유전지도 작성은 기존 Reference가 있는 작물의 경우, 형질과 연관된 영역을 탐지하거나, 새로운 Pseudomolecules을 작성하는데 기반이 될 수 있습니다. 유전지도는 육종 연구에 주로 사용되는 F1, F2, RIL(Recombination Inbred Line), DH(Double Haploid) 등의 교배 집단을 이용하여 가상의 유전지도 작성이 가능합니다.
집단의 Resequencing data 또는 GBS 데이터를 이용하여 SNP를 확보하고 일정 기준 이상의 필터과정을 거쳐 선발된 SNP 마커로 Recombination frequency 등의 통계분석을 통해 Linkage map construction을 진행합니다.
집단의 Resequencing data 또는 GBS 데이터를 이용하여 SNP를 확보하고 일정 기준 이상의 필터과정을 거쳐 선발된 SNP 마커로 Recombination frequency 등의 통계분석을 통해 Linkage map construction을 진행합니다.
Work Flow
Result Examples
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■ Linkage map의 Binmap 결과 | ■ 작성된 Linkage group의 모식도 |
관련 분석 사례 (20건)
목록
# | 소속기관 | 관련분석명 |
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1 | 정부출연(연) | 들깨 GBS 기반 유전지도 작성 |
2 | 대학교 | 카멜리나 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
3 | 국공립(연) | 소나무 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
4 | 국공립(연) | 애멸구 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 Pseudomolecule 작성 |
5 | 대학교 | 빨간배추 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
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6 | 국공립(연) | 고추 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
7 | 국공립(연) | 배 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
8 | 기업부설(연) | 무 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
9 | 기업부설(연) | 무 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
10 | 국공립(연) | 벼 RIL 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
11 | 대학교 | 억새 reciprocal 두 집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
12 | 국공립(연) | 고추 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
13 | 대학교 | 배 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
14 | 국공립(연) | 돌돔 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
15 | 국공립(연) | 포도 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
16 | 국공립(연) | 도라지 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
17 | 국공립(연) | 조피볼락 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
18 | 기업부설(연) | 무 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
19 | 대학교 | 고추 RIL 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
20 | 대학교 | 고추 RIL 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |