유전지도 작성
유전지도 작성 | QTL analysis
QTL analysis
무게나 키와 같은 질적 형질은 단일 유전자가 아닌 여러 유전자가 복합적으로 관여하며, 이 유전자의 영역을 양적 유전자좌(Quantitative Trait Loci; QTLs)라고 합니다.
QTL analysis를 통해 Genome 내에서 특정 형질에 관여하는 QTLs 영역을 탐색할 수 있습니다.
분석 대상 집단의 Resequencing 또는 GBS data를 이용하여 SNP를 확보하고 일정 기준 이상의 필터과정을 거쳐 선발된 SNP 마커로 Recombination frequency 등의 통계분석을 통해 유전지도(연관지도) 작성을 진행합니다. 작성된 유전지도와 특정 형질의 표현형 값을 이용하여 QTL 영역 탐색을 할 수 있습니다.
QTL analysis를 통해 Genome 내에서 특정 형질에 관여하는 QTLs 영역을 탐색할 수 있습니다.
분석 대상 집단의 Resequencing 또는 GBS data를 이용하여 SNP를 확보하고 일정 기준 이상의 필터과정을 거쳐 선발된 SNP 마커로 Recombination frequency 등의 통계분석을 통해 유전지도(연관지도) 작성을 진행합니다. 작성된 유전지도와 특정 형질의 표현형 값을 이용하여 QTL 영역 탐색을 할 수 있습니다.
Work Flow
Result Examples
■ 형질 관련 QTL analysis 결과
관련 분석 사례 (14건)
목록
# | 소속기관 | 관련분석명 |
---|---|---|
1 | 대학교 | 수박 RIL 집단의 WGS 기반 SNP, QTL 분석 |
2 | 대학교 | 수박 부모 및 RIL 집단의 WGS 기반 SNP 마커 및 QTL 탐색 |
3 | 대학교 | 전복 GBS 기반 연관지도 작성 및 QTL mapping/ GWAS 분석 |
4 | 기업 | 담배 F2 계통 GBS 기반 QTL mapping |
5 | 기업 | 애호박 GBS 기반 QTL mapping |
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6 | 기업 | 무 GBS 기반 연관지도 작성 및 QTL mapping |
7 | 대학교 | 카멜리나 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
8 | 대학교 | 빨간배추 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
9 | 대학교 | 배추 RAD seq data를 이용한 QTL 분석 |
10 | 국공립(연) | 배 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
11 | 기업부설(연) | 무 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
12 | 대학교 | 억새 reciprocal 두 집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
13 | 국공립(연) | 고추 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
14 | 국공립(연) | 팽이버섯 Resequencing data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |