GBS
Genome이 있는 경우에서의 GBS | Genome이 없는 경우에서의 GBS
Genome이 있는 경우에서의 GBS
GBS (Genotyping by sequencing) 기술은 Resequencing과 같은 NGS 기반의 방식이지만, 제한효소로 Genomic DNA를 절단하여 절단된 주변 서열만 부분적으로 해독하기 때문에 resequencing에 비해 비용이 절감됩니다.
GBS를 분석하고자 하는 생물 (식믈, 미생물 등)의 공개된 Reference 가 있는 경우, Reference에 sequencing reads를 Mapping하여 Reference 기반의 SNP와 50bp미만의 Small In/Del 등의 변이를 탐지할 수 있습니다.
GBS를 분석하고자 하는 생물 (식믈, 미생물 등)의 공개된 Reference 가 있는 경우, Reference에 sequencing reads를 Mapping하여 Reference 기반의 SNP와 50bp미만의 Small In/Del 등의 변이를 탐지할 수 있습니다.
Work Flow
Result Examples
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■ GBS demultiplexing 및 매핑 통계치 결과 예시 | ■ SNP matrix 엑셀 파일 예시 |
관련 분석 사례 (118건)
목록
# | 소속기관 | 관련분석명 |
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1 | 대학교 | 쥐방울덩굴 GBS 데이터를 이용한 유연관계 분석 |
2 | 기관 | 감 GBS 데이터를 이용한 SNP Matrix 작성 |
3 | 정부출연(연) | 무 GBS library 제작 및 sequencing |
4 | 기업 | 할라피뇨 고추 GBS 기반 착색지연 연관 유전자 탐색 |
5 | 대학교 | 장대나물속 식물의 GBS 유연관계 분석 |
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6 | 대학교 | 흰등멸구, 벼멸구 GBS 데이터를 이용한 유연관계 분석 |
7 | 기업 | 고추 GBS 데이터를 이용한 과색 유전자 탐색 |
8 | 대학교 | Aconitum 속 식물 GBS library 제작 및 sequencing |
9 | 대학교 | 무 F2 GBS 데이터를 이용한 연관지도 작성 |
10 | 정부출연(연) | 구절초 GBS 데이터를 이용한 유연관계 분석 |
11 | 정부출연(연) | 대사초 GBS 데이터를 이용한 유연관계 분석 |
12 | 정부출연(연) | 비수리 GBS 데이터를 이용한 유연관계분석 |
13 | 기업 | 무, 고추, 양배추 GBS 기반 SNP matrix 작성 |
14 | 기업 | 고추 양친의 WGS 및 F2집단 GBS 데이터를 이용한 GWAS 분석 |
15 | 정부출연(연) | 들깨 부모 WGS 및 자손 GBS 데이터를 이용한 유전지도 작성 |
16 | 기업 | 무순 GBS 데이터를 이용한 GWAS 분석 |
17 | 대학교 | 수박 부모 및 RIL 집단의 GBS 기반 GWAS, QTL mapping 분석 |
18 | 대학교 | 키위 GBS library 제작 및 sequencing |
19 | 정부출연(연) | 들깨 GBS 데이터를 이용한 유전지도 작성 |
20 | 대학교 | 광릉요강꽃 식물 GBS 데이터를 이용한 SNP Matrix 작성과 유연관계 분석 |
21 | 대학교 | 긴호랑거미 GBS 데이터를 이용한 SNP Matrix 작성 |
22 | 정부출연(연) | 물여뀌 GBS 데이터를 이용한 SNP Matrix 작성과 유연관계 분석 |
23 | 국공립(연) | 북극식물 draft-genome 작성 및 GBS 기반 유연관계 분석 |
24 | 정부출연(연) | 가지 GBS 기반 GWAS 분석 |
25 | 대학교 | 검은큰따개비 GBS 기반 SNP matrix 작성 |
26 | 대학교 | 큰입술갈고둥 GBS 기반 SNP matrix 작성 |
27 | 정부출연(연) | 보리 GBS 기반 GWAS 분석 |
28 | 대학교 | 장대나물속 식물 GBS 기반 유연관계 분석 |
29 | 대학교 | 전복 GBS 기반 연관지도 작성 및 QTL mapping/ GWAS 분석 |
30 | 기업 | 호박 GBS 기반 SNP matrix 작성 |
31 | 기업 | 수박 GBS 기반 SNP matrix 작성 |
32 | 기업 | 담배 F2 계통 GBS 기반 QTL mapping |
33 | 정부출연(연) | 들깨 GBS 기반 유전지도 작성 |
34 | 정부출연(연) | 오미자 targeted SSR genotyping |
35 | 대학교 | 물여뀌 GBS 기반 SNP Matrix 작성과 유연관계 분석 |
36 | 정부출연(연) | 멸구 GBS 기반 종구분 마커 탐색 |
37 | 기관 | 소나무 GBS library 제작 및 sequencing |
38 | 대학교 | 무당거미 GBS 기반 SNP matrix 작성 |
39 | 대학교 | 피나물 GBS 기반 유연관계 분석 |
40 | 대학교 | 매미꽃 GBS 기반 유연관계 분석 |
41 | 정부출연(연) | 수수 GBS 기반 유연관계 분석 |
42 | 정부출연(연) | 마 GBS 기반 유연관계 분석 |
43 | 기업 | 애호박 GBS 기반 QTL mapping |
44 | 정부출연(연) | 팥 GBS 기반 유연관계 분석 |
45 | 정부출연(연) | 고추 GBS 기반 유연관계 분석 |
46 | 대학교 | 감귤 GBS 기반 SNP matrix 작성 |
47 | 정부출연(연) | 케나프 GBS 기반 GWAS 분석 |
48 | 정부출연(연) | 토마토 GBS 기반 GWAS 분석 |
49 | 정부출연(연) | 옥수수 SSR-GBS 분석 |
50 | 기업 | 무 GBS 기반 연관지도 작성 및 QTL mapping |
51 | 정부출연(연) | 배 GBS 기반 SNP matrix 작성 |
52 | 정부출연(연) | 가지 GBS 기반 GWAS 분석, SNP 마커 선발 |
53 | 기업 | 수박 GBS 기반 SNP matrix 작성 |
54 | 정부출연(연) | 소똥구리 draft genome 작성 및 GBS 기반 유연관계 분석 |
55 | 정부출연(연) | 꿀벌 GBS 기반 유연관계 분석 |
56 | 정부출연(연) | 보리 GBS 기반 SNP matrix 작성 |
57 | 대학교 | 멸구과 GBS 기반 유연관계 분석 |
58 | 대학교 | 개별꽃속식물 GBS 기반 유연관계 분석 |
59 | 기업부설(연) | 붉은불개미 GBS data를 이용한 유연관계 분석 |
60 | 정부출연(연) | 고추 GBS data를 이용한 원품종과 돌연변이 계통 간의 SNP, In/Del 변이 탐색 |
61 | 대학교 | 땅콩 RIL 교배집단 GBS data를 이용한 SNP 탐색 |
62 | 기업부설(연) | 화상병 GBS data를 이용한 지역샘플 간의 유연관계 분석 |
63 | 대학교 | 고추 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 SNP 탐색 |
64 | 국공립(연) | 복어 GBS data를 이용한 품종구별 SNP 마커 탐색 |
65 | 국공립(연) | 상추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 & GWAS 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
66 | 대학교 | 고구마 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
67 | 국공립(연) | 푸사리움 GBS data를 이용한 병원성/비병원성 샘플 간의 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 탐색 |
68 | 국공립(연) | 참깨 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
69 | 대학교 | 카멜리나 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
70 | 대학교 | 사과 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 SNP 탐색 |
71 | 국공립(연) | 토마토 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
72 | 국공립(연) | 포도 GBS data를 이용한 GWAS 분석 |
73 | 국공립(연) | 홍화 유전자원 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 SNP 마커 탐색 |
74 | 국공립(연) | 벼 유전자원 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
75 | 기업부설(연) | 수박 GBS data를 이용한 병저항성 품종 간의 SNP 마커 탐색 |
76 | 대학교 | 배추 GBS data를 이용한 SNP 탐색 |
77 | 국공립(연) | 소나무 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
78 | 대학교 | 유채 GBS data를 이용한 샘플 간의 SNP 마커 탐색 |
79 | 대학교 | 땅콩 GBS data를 이용한 갈색무늬병 저항성/감수성 구별 SNP 마커 탐색 |
80 | 대학교 | 배 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 유연관계 분석 |
81 | 국공립(연) | 배추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 뿌리혹병 관련 GWAS 분석 |
82 | 대학교 | 빨간배추 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
83 | 대학교 | 양파 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 SNP 탐색 |
84 | 국공립(연) | 고추 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
85 | 대학교 | 사과 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성용 SNP 마커 탐색 |
86 | 기업부설(연) | 토마토 GBS data를 이용한 SNP 변이 탐색 |
87 | 대학교 | 딸기 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
88 | 국공립(연) | 소나무 교배집단 GBS data를 이용한 SNP 탐색 |
89 | 기업부설(연) | 무 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
90 | 국공립(연) | 배 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
91 | 국공립(연) | 벼 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 병저항성 관련 GWAS 분석 |
92 | 대학교 | 수박 GBS data를 이용한 SNP 분석 |
93 | 국공립(연) | 포도 F1 교배집단 GBS data를 이용한 GWAS 분석 |
94 | 대학교 | 멜론 GBS data를 이용한 SNP 분석 |
95 | 기업부설(연) | 양배추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |
96 | 국공립(연) | 토마토 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 병저항성 품종 간의 SNP 마커 탐색 |
97 | 기업부설(연) | 무 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
98 | 국공립(연) | 넙치 GBS data를 이용한 암컷 조기/후기 집단 간의 유연관계 & GWAS 분석 및 SNP 마커 탐색 |
99 | 국공립(연) | 벼 RIL 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
100 | 대학교 | 토마토 GBS data를 이용한 SNP 분석 |
101 | 국공립(연) | 포도 GBS data를 이용한 탄저병균/줄기혹병 형질관련 GWAS 분석 |
102 | 국공립(연) | 고추 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 및 QTL 분석 |
103 | 국공립(연) | 소나무 교배집단 GBS data를 이용한 SNP 탐색 |
104 | 대학교 | 포도 GBS data를 이용한 탄저병균/줄기혹병 형질관련 GWAS 분석 |
105 | 대학교 | 배 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
106 | 대학교 | 포도 GBS data를 이용한 탄저병균 형질관련 GWAS 분석 |
107 | 국공립(연) | 고구마 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
108 | 대학교 | 멜론 GBS data를 이용한 SNP 분석 |
109 | 대학교 | 배 GBS data를 이용한 유전자원 샘플 간의 유연관계 분석 |
110 | 국공립(연) | 벼 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 병저항성 관련 GWAS 분석 |
111 | 대학교 | 보이젠베리 GBS data를 이용한 Phylogenetic tree 작성 및 품종구별 SNP 마커 세트 개발 |
112 | 대학교 | 콩 GBS data를 이용한 원품종과 돌연변이 계통 간의 SNP, In/Del 변이 탐색 |
113 | 국공립(연) | 돌돔 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
114 | 대학교 | 토마토 GBS data를 이용한 SNP 분석 |
115 | 국공립(연) | 포도 F1 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
116 | 국공립(연) | 넙치 GBS data를 이용한 수컷 조기/후기 집단 간의 유연관계 & GWAS 분석 및 SNP 마커 탐색 |
117 | 국공립(연) | 도라지 F2 교배집단 GBS data를 이용한 유전지도 작성 |
118 | 국공립(연) | 양배추 GBS data를 이용한 유연관계 분석 및 GWAS 분석 |