Genome de novo assembly
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Virus genome assembly
식물 RNA sequencing data를 이용하여 식물에서 유래하는 서열을 제거한 뒤에 RNA de novo assembly를 수행하여 새로운 종의 RNA바이러스 genome을 조립하고 알려진 데이터베이스를 통해 서열유사성을 확인합니다.
Work Flow
Result Examples
■ De novo assembly 및 de novo assembly 서열의 virus annotation 결과
관련 분석 사례 (18건)
목록
# | 소속기관 | 관련분석명 |
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1 | 정부출연(연) | 감 genome assembly & gene prediction |
2 | 대학교 | 토마토 genome의 gene prediction |
3 | 대학교 | 미선나무 gene model annotation |
4 | 대학교 | 개나리 gene model annotation |
5 | 정부출연(연) | 효모 hybrid genome assembly |
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6 | 기업 | Bacillus reference guided assembly 작성 |
7 | 정부출연(연) | Fusarium nanopore data 기반 draft genome 작성 |
8 | 기업 | 작약 WGS 기반 draft genome 작성 |
9 | 대학교 | 화상병균 WGS 기반 reference guided assembly |
10 | 대학교 | 미선나무 WGS 기반 draft genome 작성 |
11 | 대학교 | 억새 WGS 기반 reference guided assembly |
12 | 정부출연(연) | 에뜰리아 Chloroplast assembly |
13 | 대학교 | 수수 RNA-seq을 이용한 바이러스 서열 검출 분석 |
14 | 대학교 | 기장 RNA-seq을 이용한 바이러스 서열 검출 분석 |
15 | 대학교 | 조 RNA-seq을 이용한 바이러스 서열 검출 분석 |
16 | 대학교 | 팥 RNA-seq을 이용한 바이러스 서열 검출 분석 |
17 | 대학교 | 콩 RNA-seq을 이용한 바이러스 서열 검출 분석 |
18 | 대학교 | 잡초 RNA-seq을 이용한 바이러스 서열 검출 분석 |