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software | 육종지원용 웹 Database 구축

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작성자 이솔지 작성일18-09-07 14:00 조회100회 댓글0건

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육종지원용 웹 Database 구축
유전체 정보 실용화를 지원하는 웹 인터페이스 개발
 
씨더스는 유전체 정보의 소통 및 산업화를 위한 데이터베이스의 활용을 돕고자 현장(연구팀 혹은 커뮤니티)의 의견을 유기적으로 교환하여 다양한 웹 데이터베이스를 구축하여 공유하는데 노력해 왔습니다. 이러한 과정에서 습득하고 누적된 기술을 이용하여 유전체 정보 분석결과를 차별화된 방법으로 해석하고 정리하여 기존의 수치 위주의 구성이 아닌 이해하기 쉽고 활용도 높은 시각적인 웹 데이터베이스를 구현하여 정보를 연구에 활용할 수 있도록 맞춤형 웹 데이터베이스를 구축하여 드립니다.
 
 
< 육종 지원 웹 기반 데이터베이스 개발 사례 >
 
-가지과 작물(토마토, 고추, 감자)의 유전체 정보 실용화 Web DB
*TGsol  Web DB 인터페이스
Genome Browser 구현
교배 조합별 MAB용 마커 제공
형질연관 MAS용 마커 제공
가지과 작물 간 Comparative synteny viewer 제공
유전체 조성 분석 DB 구축
 
-과수작물(포도,머루 등)의 분자 육종 지원 Web DB
 
*과수작물  Web DB 인터페이스
 
주요 형질 QTL mapping 결과 및 마커 정보 제공
SNP 마커 기반 유전지도 정보 제공
RNAseq 기반 유전자 발현 값 DB 구축
DEG 유전자 대사 회로 연결 정보 제공
GBS 데이터 기반의 유전형 DB 구축 및 제공
Genome Browser 구현
 
 
 
 
 
< 풍부한 웹 기반 데이터베이스 개발 사례 >
 
-작물 별, 목적 별 Web DB 개발 사례
 
     Web DB 제공 서비스
Genome Browser 구현 (표준유전체, gene modeling)
SNP 마커 개발 및 정보 제공
표준 유전자 세트 확보
조직 별, 처리 별 유전자 발현 정보
 
 
< 유전체 분석 결과 가시화 (Visualization tools) 서비스>
 

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